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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

浙皖闽赣国家生态旅游协作区线上推进会推出旅游优惠政策******

　　本报讯 （驻福建记者黄国勇）12月8日，以“推进区域协作共赢 共建生态旅游典范”为主题的2022年浙皖闽赣国家生态旅游协作区线上推进会召开，四省联合发布“浙皖闽赣惠游季”活动与《“95联盟风景道”建设倡议书》等，推出一系列旅游优惠政策。

　　12月至春节期间，“浙皖闽赣惠游季”活动将合计推出春节主题特卖活动、旅游景区免费、消费券发放等近500项文旅营销活动、200余项惠民措施，共同促进区域内文旅消费提质扩容。

　　根据会议发布的《“95联盟风景道”建设倡议书》，浙皖闽赣四省将共同打造长1995公里，串联9个国家5A级旅游景区，覆盖浙皖闽赣四省交界处的衢州、黄山、南平、上饶四个城市的“95联盟风景道”，并提倡推动浙皖闽赣联盟上升为国家战略，加快建设“一道（风景道）一带（旅游带）一区（拓展区）”的“鱼骨状”线性空间布局，共同打造线性景区，提升满足风景道及沿线旅游产品的基本功能需求，共同打响“浙·里山水”“皖·美旅游”“闽·扬天下”“赣·出精彩”四省旅游品牌。

　　会议通过宣传片展示了协作区的生态旅游资源与人文景观，回顾了协作区成立以来四省交流合作的突出成果。衢州、黄山、南平、上饶四市总工会签订了《衢黄南饶“联盟花园”职工疗休养合作框架协议》，南平市文化和旅游局与上饶市全域旅游发展中心签订《四省城际旅游直通车（南平—上饶）试点协议》。

　　此外，会议宣布2023年浙皖闽赣国家生态旅游协作区推进会举办地为浙江省温州市。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）